1945年，游學(xué)歸來的刑偵專家程慈航，在碼頭遭遇險情，多方勢力為爭奪一只鐵箱大開殺戒。這只鐵箱里，存放著日軍細(xì)菌武器的絕密檔案。警察廳廳長莫采石將鐵箱存放在檔案館密室內(nèi)。由于內(nèi)鬼劉阿常的出賣，檔案被盜，案情從此撲朔迷離。程慈航獲悉此案事關(guān)日軍細(xì)菌武器，向“叔叔”莫采石請戰(zhàn)，總署刑偵警察局局長霍然隨即特聘程慈航為布衣偵探。程慈航上任后，很快找到蛛絲馬跡，順藤摸瓜接連捕獲重大線索，然而他卻處處受阻。程慈航既要面對刑偵處處長嚴(yán)達(dá)慶的百般阻撓，又要揣測莫采石的諱深莫測，還要與他的老同學(xué)、對絕密檔案覦覬已久的哈金斯斗智斗勇，更要與日本間諜博弈較量。內(nèi)賊劉阿常的死，留下關(guān)鍵線索，矛頭直指莫采石。戀人楊玉瓊的犧牲，使程慈航愛恨交加，更加堅定信念一查到底。程慈航最終摧毀檔案，大義鋤惡，與莫采石同歸于盡。